我们日常所说的哈士奇的阴阳眼与电影电视里说的阴阳眼不是一回事，哈士奇的阴阳眼也就是鸳鸯眼，是两只眼睛颜色不一样的一种简化说法，哈士奇的阴阳眼是可能有一只眼是棕色或浅褐色的，而另一只却是蓝色的，这种现象被称作"bi-eyed";或者一只眼是蓝色的而另一只眼的虹膜是杂色的，即虹膜异色症，被饲养西伯利亚雪撬犬的爱好者称为"parti-eyed"。是由于基因的显形和隐性问题导致的。
一般来说哈士奇的眼睛颜色常见的有三种，分别是褐色、棕色以及蓝色。从基因上来说蓝色眼睛是因为基因变异或者有缺陷才会生成。不过历来哈士奇这个犬种就有蓝眼，并且通过遗传一直至今，算是成为了哈士奇的一个特点。而现在的蓝眼，褐色眼或者阴阳眼已经涉及不到基因优劣的问题了，纯粹就是样子不同而已。
虹膜异色症的出现，可以分成先天和后天两方面。先天既是基因问题导致的，而后天则是因为患上Horner Syndrome或虹膜毛样体炎，使虹膜造成损伤而萎缩。也有可能是虹膜色素缺失引起，或与基因有关。
